Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RNF17Q9BXT8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms