Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNG6Q9BXT2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms