Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BBS2Q9BXC9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BBS2Q9BXC9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BBS2Q9BXC9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BBS2Q9BXC9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BBS2Q9BXC9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
BBS2Q9BXC9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BBS2Q9BXC9 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BBS2Q9BXC9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
BBS2Q9BXC9 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BBS2Q9BXC9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BBS2Q9BXC9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BBS2Q9BXC9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BBS2Q9BXC9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS2Q9BXC9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms