Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HIRIP3Q9BW71 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HIRIP3Q9BW71 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms