Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms