Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP8Q9BV40 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP8Q9BV40 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP8Q9BV40 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP8Q9BV40 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP8Q9BV40 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP8Q9BV40 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP8Q9BV40 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP8Q9BV40 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP8Q9BV40 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP8Q9BV40 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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