Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAGR1Q9BTK6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms