Protein–RNA interactions for Protein: Q99942

RNF5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, humanhuman

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF5Q99942 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF5Q99942 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF5Q99942 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF5Q99942 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF5Q99942 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF5Q99942 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF5Q99942 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF5Q99942 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF5Q99942 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF5Q99942 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF5Q99942 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF5Q99942 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF5Q99942 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF5Q99942 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF5Q99942 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF5Q99942 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF5Q99942 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF5Q99942 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF5Q99942 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF5Q99942 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF5Q99942 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF5Q99942 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF5Q99942 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF5Q99942 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF5Q99942 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF5Q99942 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF5Q99942 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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RNF5Q99942 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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RNF5Q99942 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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RNF5Q99942 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF5Q99942 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF5Q99942 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF5Q99942 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF5Q99942 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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RNF5Q99942 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF5Q99942 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF5Q99942 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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RNF5Q99942 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF5Q99942 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF5Q99942 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF5Q99942 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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RNF5Q99942 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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RNF5Q99942 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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RNF5Q99942 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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RNF5Q99942 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF5Q99942 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF5Q99942 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF5Q99942 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF5Q99942 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF5Q99942 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF5Q99942 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF5Q99942 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF5Q99942 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF5Q99942 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF5Q99942 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF5Q99942 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF5Q99942 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF5Q99942 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF5Q99942 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF5Q99942 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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