Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MEIS3Q99687 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MEIS3Q99687 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms