Protein–RNA interactions for Protein: Q99590

SCAF11, Protein SCAF11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF11Q99590 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SCAF11Q99590 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SCAF11Q99590 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SCAF11Q99590 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SCAF11Q99590 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCAF11Q99590 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCAF11Q99590 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCAF11Q99590 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCAF11Q99590 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SCAF11Q99590 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCAF11Q99590 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCAF11Q99590 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SCAF11Q99590 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCAF11Q99590 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SCAF11Q99590 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCAF11Q99590 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCAF11Q99590 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCAF11Q99590 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCAF11Q99590 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCAF11Q99590 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCAF11Q99590 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCAF11Q99590 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCAF11Q99590 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCAF11Q99590 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCAF11Q99590 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCAF11Q99590 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SCAF11Q99590 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCAF11Q99590 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCAF11Q99590 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCAF11Q99590 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCAF11Q99590 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCAF11Q99590 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SCAF11Q99590 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SCAF11Q99590 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SCAF11Q99590 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SCAF11Q99590 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SCAF11Q99590 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SCAF11Q99590 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SCAF11Q99590 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SCAF11Q99590 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SCAF11Q99590 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SCAF11Q99590 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SCAF11Q99590 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SCAF11Q99590 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SCAF11Q99590 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SCAF11Q99590 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SCAF11Q99590 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SCAF11Q99590 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SCAF11Q99590 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCAF11Q99590 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCAF11Q99590 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCAF11Q99590 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCAF11Q99590 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SCAF11Q99590 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms