Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms