Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SIN3AQ96ST3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SIN3AQ96ST3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms