Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms