Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 C20orf85-201ENST00000371168 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 AL139353.2-202ENST00000502430 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms