Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC38A2Q96QD8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms