Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q77

CIB3, Calcium and integrin-binding family member 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIB3Q96Q77 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIB3Q96Q77 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms