Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LMTK3Q96Q04 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LMTK3Q96Q04 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMTK3Q96Q04 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMTK3Q96Q04 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMTK3Q96Q04 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMTK3Q96Q04 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMTK3Q96Q04 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
LMTK3Q96Q04 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMTK3Q96Q04 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMTK3Q96Q04 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMTK3Q96Q04 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
LMTK3Q96Q04 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMTK3Q96Q04 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMTK3Q96Q04 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LMTK3Q96Q04 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LMTK3Q96Q04 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LMTK3Q96Q04 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms