Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORCS2Q96PQ0 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms