Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GBP4Q96PP9 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms