Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW7

LRRC7, Leucine-rich repeat-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC7Q96NW7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC7Q96NW7 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms