Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCMTD1Q96MG8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCMTD1Q96MG8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCMTD1Q96MG8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCMTD1Q96MG8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCMTD1Q96MG8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCMTD1Q96MG8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCMTD1Q96MG8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCMTD1Q96MG8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCMTD1Q96MG8 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCMTD1Q96MG8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PCMTD1Q96MG8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCMTD1Q96MG8 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PCMTD1Q96MG8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PCMTD1Q96MG8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PCMTD1Q96MG8 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PCMTD1Q96MG8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCMTD1Q96MG8 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms