Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9orf72Q96LT7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9orf72Q96LT7 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9orf72Q96LT7 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
C9orf72Q96LT7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C9orf72Q96LT7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C9orf72Q96LT7 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C9orf72Q96LT7 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C9orf72Q96LT7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C9orf72Q96LT7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C9orf72Q96LT7 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C9orf72Q96LT7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C9orf72Q96LT7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C9orf72Q96LT7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C9orf72Q96LT7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C9orf72Q96LT7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
C9orf72Q96LT7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C9orf72Q96LT7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C9orf72Q96LT7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C9orf72Q96LT7 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C9orf72Q96LT7 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C9orf72Q96LT7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C9orf72Q96LT7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C9orf72Q96LT7 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C9orf72Q96LT7 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C9orf72Q96LT7 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C9orf72Q96LT7 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C9orf72Q96LT7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C9orf72Q96LT7 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C9orf72Q96LT7 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C9orf72Q96LT7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C9orf72Q96LT7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C9orf72Q96LT7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C9orf72Q96LT7 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C9orf72Q96LT7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C9orf72Q96LT7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
C9orf72Q96LT7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C9orf72Q96LT7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
C9orf72Q96LT7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C9orf72Q96LT7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
C9orf72Q96LT7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C9orf72Q96LT7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C9orf72Q96LT7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C9orf72Q96LT7 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
C9orf72Q96LT7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C9orf72Q96LT7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C9orf72Q96LT7 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C9orf72Q96LT7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C9orf72Q96LT7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C9orf72Q96LT7 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C9orf72Q96LT7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
C9orf72Q96LT7 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C9orf72Q96LT7 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C9orf72Q96LT7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C9orf72Q96LT7 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C9orf72Q96LT7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C9orf72Q96LT7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C9orf72Q96LT7 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C9orf72Q96LT7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C9orf72Q96LT7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C9orf72Q96LT7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
C9orf72Q96LT7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C9orf72Q96LT7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C9orf72Q96LT7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C9orf72Q96LT7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C9orf72Q96LT7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C9orf72Q96LT7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C9orf72Q96LT7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C9orf72Q96LT7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C9orf72Q96LT7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C9orf72Q96LT7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
C9orf72Q96LT7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C9orf72Q96LT7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C9orf72Q96LT7 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C9orf72Q96LT7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C9orf72Q96LT7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C9orf72Q96LT7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C9orf72Q96LT7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C9orf72Q96LT7 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C9orf72Q96LT7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C9orf72Q96LT7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C9orf72Q96LT7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
C9orf72Q96LT7 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C9orf72Q96LT7 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C9orf72Q96LT7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C9orf72Q96LT7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C9orf72Q96LT7 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
C9orf72Q96LT7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C9orf72Q96LT7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C9orf72Q96LT7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C9orf72Q96LT7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
C9orf72Q96LT7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C9orf72Q96LT7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C9orf72Q96LT7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C9orf72Q96LT7 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C9orf72Q96LT7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C9orf72Q96LT7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C9orf72Q96LT7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C9orf72Q96LT7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C9orf72Q96LT7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms