Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms