Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKNOX2Q96KN3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms