Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms