Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPNQ96H22 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms