Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SCMH1Q96GD3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms