Protein–RNA interactions for Protein: Q96FQ7

LINC00526, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00526, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00526Q96FQ7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00526Q96FQ7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00526Q96FQ7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00526Q96FQ7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00526Q96FQ7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00526Q96FQ7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00526Q96FQ7 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00526Q96FQ7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00526Q96FQ7 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00526Q96FQ7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00526Q96FQ7 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00526Q96FQ7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00526Q96FQ7 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00526Q96FQ7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00526Q96FQ7 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00526Q96FQ7 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00526Q96FQ7 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00526Q96FQ7 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00526Q96FQ7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00526Q96FQ7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00526Q96FQ7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00526Q96FQ7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00526Q96FQ7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00526Q96FQ7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00526Q96FQ7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00526Q96FQ7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms