Protein–RNA interactions for Protein: Q96FF9

CDCA5, Sororin, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA5Q96FF9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDCA5Q96FF9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDCA5Q96FF9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDCA5Q96FF9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDCA5Q96FF9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDCA5Q96FF9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDCA5Q96FF9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDCA5Q96FF9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDCA5Q96FF9 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDCA5Q96FF9 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDCA5Q96FF9 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CDCA5Q96FF9 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDCA5Q96FF9 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CDCA5Q96FF9 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDCA5Q96FF9 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDCA5Q96FF9 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDCA5Q96FF9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDCA5Q96FF9 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDCA5Q96FF9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDCA5Q96FF9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDCA5Q96FF9 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CDCA5Q96FF9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDCA5Q96FF9 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDCA5Q96FF9 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDCA5Q96FF9 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDCA5Q96FF9 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDCA5Q96FF9 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDCA5Q96FF9 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDCA5Q96FF9 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDCA5Q96FF9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDCA5Q96FF9 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDCA5Q96FF9 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CDCA5Q96FF9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDCA5Q96FF9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDCA5Q96FF9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDCA5Q96FF9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDCA5Q96FF9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDCA5Q96FF9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDCA5Q96FF9 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDCA5Q96FF9 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDCA5Q96FF9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDCA5Q96FF9 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDCA5Q96FF9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDCA5Q96FF9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDCA5Q96FF9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDCA5Q96FF9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDCA5Q96FF9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA5Q96FF9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA5Q96FF9 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA5Q96FF9 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA5Q96FF9 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA5Q96FF9 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA5Q96FF9 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA5Q96FF9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA5Q96FF9 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA5Q96FF9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA5Q96FF9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA5Q96FF9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA5Q96FF9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA5Q96FF9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA5Q96FF9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA5Q96FF9 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA5Q96FF9 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA5Q96FF9 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA5Q96FF9 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA5Q96FF9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA5Q96FF9 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA5Q96FF9 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA5Q96FF9 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA5Q96FF9 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA5Q96FF9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA5Q96FF9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA5Q96FF9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA5Q96FF9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA5Q96FF9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA5Q96FF9 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA5Q96FF9 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA5Q96FF9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA5Q96FF9 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA5Q96FF9 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA5Q96FF9 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA5Q96FF9 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA5Q96FF9 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA5Q96FF9 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA5Q96FF9 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA5Q96FF9 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA5Q96FF9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA5Q96FF9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA5Q96FF9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA5Q96FF9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA5Q96FF9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA5Q96FF9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA5Q96FF9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA5Q96FF9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCA5Q96FF9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCA5Q96FF9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCA5Q96FF9 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCA5Q96FF9 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCA5Q96FF9 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCA5Q96FF9 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms