Protein–RNA interactions for Protein: Q96ER9

CCDC51, Coiled-coil domain-containing protein 51, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC51Q96ER9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC51Q96ER9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms