Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
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