Protein–RNA interactions for Protein: Q96AQ1

CCDC74A, Coiled-coil domain-containing protein 74A, humanhuman

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Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74AQ96AQ1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC74AQ96AQ1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC74AQ96AQ1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC74AQ96AQ1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC74AQ96AQ1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC74AQ96AQ1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC74AQ96AQ1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC74AQ96AQ1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC74AQ96AQ1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC74AQ96AQ1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC74AQ96AQ1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC74AQ96AQ1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC74AQ96AQ1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC74AQ96AQ1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC74AQ96AQ1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC74AQ96AQ1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC74AQ96AQ1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC74AQ96AQ1 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC74AQ96AQ1 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC74AQ96AQ1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC74AQ96AQ1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC74AQ96AQ1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC74AQ96AQ1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC74AQ96AQ1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC74AQ96AQ1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC74AQ96AQ1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC74AQ96AQ1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC74AQ96AQ1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC74AQ96AQ1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC74AQ96AQ1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC74AQ96AQ1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC74AQ96AQ1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC74AQ96AQ1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC74AQ96AQ1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC74AQ96AQ1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC74AQ96AQ1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC74AQ96AQ1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC74AQ96AQ1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC74AQ96AQ1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC74AQ96AQ1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC74AQ96AQ1 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC74AQ96AQ1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC74AQ96AQ1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
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CCDC74AQ96AQ1 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC74AQ96AQ1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC74AQ96AQ1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC74AQ96AQ1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC74AQ96AQ1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC74AQ96AQ1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC74AQ96AQ1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
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CCDC74AQ96AQ1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC74AQ96AQ1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC74AQ96AQ1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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CCDC74AQ96AQ1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC74AQ96AQ1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC74AQ96AQ1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC74AQ96AQ1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC74AQ96AQ1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC74AQ96AQ1 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
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CCDC74AQ96AQ1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC74AQ96AQ1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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CCDC74AQ96AQ1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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CCDC74AQ96AQ1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
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CCDC74AQ96AQ1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC74AQ96AQ1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC74AQ96AQ1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC74AQ96AQ1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC74AQ96AQ1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC74AQ96AQ1 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC74AQ96AQ1 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC74AQ96AQ1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC74AQ96AQ1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC74AQ96AQ1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC74AQ96AQ1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC74AQ96AQ1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC74AQ96AQ1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC74AQ96AQ1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC74AQ96AQ1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC74AQ96AQ1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC74AQ96AQ1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC74AQ96AQ1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC74AQ96AQ1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC74AQ96AQ1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC74AQ96AQ1 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC74AQ96AQ1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC74AQ96AQ1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC74AQ96AQ1 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
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