Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD50Q92878 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms