Protein–RNA interactions for Protein: Q92784

DPF3, Zinc finger protein DPF3, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPF3Q92784 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DPF3Q92784 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms