Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms