Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW43

APH1B, Gamma-secretase subunit APH-1B, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APH1BQ8WW43 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APH1BQ8WW43 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms