Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVY7

UBLCP1, Ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBLCP1Q8WVY7 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBLCP1Q8WVY7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms