Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC71

SPATA18, Mitochondria-eating protein, humanhuman

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Length 538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA18Q8TC71 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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SPATA18Q8TC71 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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SPATA18Q8TC71 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
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SPATA18Q8TC71 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
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SPATA18Q8TC71 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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SPATA18Q8TC71 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPATA18Q8TC71 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
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