Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms