Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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