Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CARMIL3Q8ND23 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CARMIL3Q8ND23 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms