Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms