Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C0

C9orf62, Putative uncharacterized protein C9orf62, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf62Q8N4C0 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf62Q8N4C0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf62Q8N4C0 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf62Q8N4C0 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf62Q8N4C0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf62Q8N4C0 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf62Q8N4C0 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf62Q8N4C0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf62Q8N4C0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf62Q8N4C0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf62Q8N4C0 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf62Q8N4C0 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf62Q8N4C0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf62Q8N4C0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf62Q8N4C0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf62Q8N4C0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf62Q8N4C0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf62Q8N4C0 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf62Q8N4C0 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf62Q8N4C0 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf62Q8N4C0 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf62Q8N4C0 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf62Q8N4C0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf62Q8N4C0 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf62Q8N4C0 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf62Q8N4C0 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf62Q8N4C0 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf62Q8N4C0 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf62Q8N4C0 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf62Q8N4C0 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf62Q8N4C0 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf62Q8N4C0 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf62Q8N4C0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf62Q8N4C0 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf62Q8N4C0 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf62Q8N4C0 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf62Q8N4C0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf62Q8N4C0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf62Q8N4C0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf62Q8N4C0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf62Q8N4C0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf62Q8N4C0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf62Q8N4C0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf62Q8N4C0 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf62Q8N4C0 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf62Q8N4C0 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf62Q8N4C0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf62Q8N4C0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms