Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms