Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6E9

RBBP6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP6Q7Z6E9 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBBP6Q7Z6E9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
RBBP6Q7Z6E9 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
RBBP6Q7Z6E9 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBBP6Q7Z6E9 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBBP6Q7Z6E9 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RBBP6Q7Z6E9 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBBP6Q7Z6E9 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBBP6Q7Z6E9 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBBP6Q7Z6E9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBBP6Q7Z6E9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBBP6Q7Z6E9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms