Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Q1

SLC46A3, Solute carrier family 46 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC46A3Q7Z3Q1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC46A3Q7Z3Q1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC46A3Q7Z3Q1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC46A3Q7Z3Q1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC46A3Q7Z3Q1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms