Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHLHA9Q7RTU4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BHLHA9Q7RTU4 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BHLHA9Q7RTU4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BHLHA9Q7RTU4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BHLHA9Q7RTU4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BHLHA9Q7RTU4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BHLHA9Q7RTU4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
BHLHA9Q7RTU4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BHLHA9Q7RTU4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BHLHA9Q7RTU4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BHLHA9Q7RTU4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BHLHA9Q7RTU4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BHLHA9Q7RTU4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BHLHA9Q7RTU4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BHLHA9Q7RTU4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHA9Q7RTU4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHA9Q7RTU4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHA9Q7RTU4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHA9Q7RTU4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHA9Q7RTU4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHA9Q7RTU4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHA9Q7RTU4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHA9Q7RTU4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHA9Q7RTU4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHA9Q7RTU4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHA9Q7RTU4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHA9Q7RTU4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHA9Q7RTU4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHA9Q7RTU4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHA9Q7RTU4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHA9Q7RTU4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHA9Q7RTU4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHA9Q7RTU4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHA9Q7RTU4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHA9Q7RTU4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHA9Q7RTU4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHA9Q7RTU4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHA9Q7RTU4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHA9Q7RTU4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHA9Q7RTU4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHA9Q7RTU4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
BHLHA9Q7RTU4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHLHA9Q7RTU4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHLHA9Q7RTU4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHLHA9Q7RTU4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHLHA9Q7RTU4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHLHA9Q7RTU4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHLHA9Q7RTU4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHLHA9Q7RTU4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHLHA9Q7RTU4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHLHA9Q7RTU4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHLHA9Q7RTU4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHLHA9Q7RTU4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BHLHA9Q7RTU4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BHLHA9Q7RTU4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BHLHA9Q7RTU4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BHLHA9Q7RTU4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BHLHA9Q7RTU4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BHLHA9Q7RTU4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BHLHA9Q7RTU4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BHLHA9Q7RTU4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BHLHA9Q7RTU4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BHLHA9Q7RTU4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BHLHA9Q7RTU4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
BHLHA9Q7RTU4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BHLHA9Q7RTU4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BHLHA9Q7RTU4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BHLHA9Q7RTU4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BHLHA9Q7RTU4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms