Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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