Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
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USP31Q70CQ4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP31Q70CQ4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
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