Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSY5

PPP1R3F, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3FQ6ZSY5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP1R3FQ6ZSY5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP1R3FQ6ZSY5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP1R3FQ6ZSY5 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP1R3FQ6ZSY5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP1R3FQ6ZSY5 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP1R3FQ6ZSY5 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP1R3FQ6ZSY5 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP1R3FQ6ZSY5 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP1R3FQ6ZSY5 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP1R3FQ6ZSY5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP1R3FQ6ZSY5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP1R3FQ6ZSY5 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP1R3FQ6ZSY5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP1R3FQ6ZSY5 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP1R3FQ6ZSY5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP1R3FQ6ZSY5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP1R3FQ6ZSY5 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP1R3FQ6ZSY5 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP1R3FQ6ZSY5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP1R3FQ6ZSY5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP1R3FQ6ZSY5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP1R3FQ6ZSY5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP1R3FQ6ZSY5 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP1R3FQ6ZSY5 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP1R3FQ6ZSY5 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP1R3FQ6ZSY5 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP1R3FQ6ZSY5 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP1R3FQ6ZSY5 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP1R3FQ6ZSY5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP1R3FQ6ZSY5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP1R3FQ6ZSY5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP1R3FQ6ZSY5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP1R3FQ6ZSY5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP1R3FQ6ZSY5 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP1R3FQ6ZSY5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP1R3FQ6ZSY5 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP1R3FQ6ZSY5 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP1R3FQ6ZSY5 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP1R3FQ6ZSY5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP1R3FQ6ZSY5 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP1R3FQ6ZSY5 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP1R3FQ6ZSY5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP1R3FQ6ZSY5 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP1R3FQ6ZSY5 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP1R3FQ6ZSY5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP1R3FQ6ZSY5 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP1R3FQ6ZSY5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP1R3FQ6ZSY5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PPP1R3FQ6ZSY5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PPP1R3FQ6ZSY5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP1R3FQ6ZSY5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP1R3FQ6ZSY5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP1R3FQ6ZSY5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP1R3FQ6ZSY5 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP1R3FQ6ZSY5 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP1R3FQ6ZSY5 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP1R3FQ6ZSY5 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP1R3FQ6ZSY5 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP1R3FQ6ZSY5 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP1R3FQ6ZSY5 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP1R3FQ6ZSY5 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP1R3FQ6ZSY5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP1R3FQ6ZSY5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP1R3FQ6ZSY5 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP1R3FQ6ZSY5 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP1R3FQ6ZSY5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP1R3FQ6ZSY5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP1R3FQ6ZSY5 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP1R3FQ6ZSY5 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP1R3FQ6ZSY5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP1R3FQ6ZSY5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP1R3FQ6ZSY5 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP1R3FQ6ZSY5 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP1R3FQ6ZSY5 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP1R3FQ6ZSY5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP1R3FQ6ZSY5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP1R3FQ6ZSY5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP1R3FQ6ZSY5 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP1R3FQ6ZSY5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP1R3FQ6ZSY5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP1R3FQ6ZSY5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP1R3FQ6ZSY5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP1R3FQ6ZSY5 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP1R3FQ6ZSY5 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP1R3FQ6ZSY5 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP1R3FQ6ZSY5 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP1R3FQ6ZSY5 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP1R3FQ6ZSY5 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP1R3FQ6ZSY5 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP1R3FQ6ZSY5 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP1R3FQ6ZSY5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP1R3FQ6ZSY5 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP1R3FQ6ZSY5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP1R3FQ6ZSY5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP1R3FQ6ZSY5 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP1R3FQ6ZSY5 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP1R3FQ6ZSY5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP1R3FQ6ZSY5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP1R3FQ6ZSY5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms